存入保证金是指企业或个人在与其他单位或个人进行某些交易时，为保证交易的安全性和可靠性，按照约定将一定金额的资金存入第三方的银行账户中，以备以后可能发生的违约、赔偿、损失等情况而使用的一种方式。存入保证金计入的科目是“保证金”科目，该科目属于资产类科目，是指企业或个人所存入的保证金金额。在会计核算中，企业或个人存入保证金后应当在会计账簿中开立“保证金”账户，并将存入的保证金金额计入该账户中。
存出保证金是指在存入保证金后，如果交易的安全性和可靠性得到了保障，或者交易已经完成，那么存入的保证金就可以按照约定的方式进行退还或者使用。此时，企业或个人需要向第三方提出存出保证金的申请，并在第三方的银行账户中进行相应的操作，将保证金退回或使用。存出保证金计入的科目是“应付保证金”科目，该科目属于负债类科目，是指企业或个人应当向第三方支付的保证金金额。在会计核算中，企业或个人存出保证金后应当在会计账簿中开立“应付保证金”账户，并将应付的保证金金额计入该账户中。
总之，存入保证金和存出保证金是一种常见的商业交易方式，其核算方法和科目处理应当符合会计准则的规定，以确保企业财务信息的真实、准确和可靠。